Sool Lee, Jessica C McAfee, Jiseok Lee, Alejandro Gomez, Austin T Ledford, Declan Clarke, Hyunggyu Min, Mark B Gerstein, Alan P Boyle, Patrick F Sullivan, Adriana S Beltran, Hyejung Won
Abstrak
Sebuah studi asosiasi genome-wide yang mencakup 8 gangguan psikiatrik menyoroti arsitektur genetik pleiotropi pada gangguan psikiatrik utama. Namun, mekanisme yang mendasari efek pleiotropik dari varian-varian terkait masih perlu diteliti. Kami melaksanakan uji reporter paralel berskala masif untuk menguraikan logika regulasi dari varian-varian yang memiliki efek pleiotropik maupun efek spesifik terhadap gangguan tertentu. Varian pleiotropik berbeda dari varian yang spesifik terhadap gangguan tertentu karena menunjukkan aksesibilitas kromatin yang meluas pada berbagai jenis sel dalam garis keturunan neuronal dan dengan merubah motif faktor transkripsi yang memiliki konektivitas tinggi dalam jejaring interaksi protein-protein. Kami telah memetakan varian pleiotropik dan varian spesifik gangguan ke gen target yang menggunakan pendekatan genomic fungsional dan perturbasi CRISPR. Perturbasi CRISPR in vivo terhadap gen spesifik gangguan dan gen pleiotropik mungkin melibatkan regulasi gen yang diekspresikan secara luas pada berbagai tipe sel neuronal dan memiliki konektivitas jaringan yang lebih tinggi.
Tautan ke artikel lengkap: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39848247/
Kalimat Kutipan: Lee S, McAfee JC, Lee J, Gomez A, Ledford AT, Clarke D, Min H, Gerstein MB, Boyle AP, Sullivan PF, Beltran AS, Won H. Massively parallel reporter assay investigates shared genetic variants of eight psychiatric disorders. Cell. 2025 Mar 6;188(5):1409-1424.e21. doi: 10.1016/j.cell.2024.12.022. Epub 2025 Jan 22. PMID: 39848247; PMCID: PMC11890967.
